โรงเรียนชุมชนบ้านทางควาย เดิมชื่อโรงเรียนประชาบาล อ.จะโหนง 3 (เรือนประชาบาล) เปิดสอนที่สุเหร่าบ้านตรับ เมื่อวันที่ 7 มิถุนายน 2482 มีนักเรียน จำนวน 65 คน

           นายเกื้อ ทองชนะ รักษาการ ในตำแหน่งครูใหญ่ วันที่ 4 พฤษภาคม 2484 ได้ทำการก่อสร้างอาคารชั่วคราวในที่ดินของนายขุนหมื่น จันทรักษ์ ซึ่งบริจาคที่ดินให้ และย้ายนักเรียนมาเรียน วันที่ 10 สิงหาคม 2495 ก่อสร้างอาคารเรียนหลังที่ 1 แบบ ป.3 ขนาด 3 ห้องเรียน ขนาด 7 x 9 เมตร โดยได้รับบริจาคจากคณะครู การจัดหาเงินในขั้นแรกได้เพียงรากฐานคานคอดินเท่านั้น

• วันที่ 1 กันยายน 2495 เปลี่ยนชื่อเป็น โรงเรียนบ้านทางควาย ได้รับเงินสมทบจำนวน 50,000 บาท รับเงินบริจาคจาก ส.อ.ประณีต กลิ่นโกศรม มาต่อเติมฝาผนัง
• วันที่ 1 ธันวาคม 2501 ได้รับงบประมาณจำนวน 30,000 บาท ทำการก่อสร้างจนแล้วเสร็จ 
• วันที่ 1 มกราคม 2502 คณะครูและนักเรียนร่วมกันสร้างโรงอาหาร 1 หลัง 
• วันที่ 4 ธันวาคม 2503 สร้างอาคารเรียนหลังที่ 2 แบบ ป.3 ขนาด 7 x 9 เมตร 3 ห้องเรียน 
• ปีงบประมาณ 2508 ได้รับงบประมาณสร้างบ้านพักครู 1 หลัง จำนวน 12,000 บาท 
• ปี 2511 ได้รับงบประมาณจำนวน 45,000 บาท สร้าง โรงฝึกงานแบบ กรมสามัญ 312 จำนวน 1 หลัง 
• ปี 2513 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียนแบบ 017 ขนาด 4 ห้องเรียน ไม่ทาสี 1 หลัง จำนวน 210,000 บาท 
• วันที่ 4 พฤศจิกายน 2518 คณะครู-ภารโรงร่วมกันสร้างโรงจอดรถถาวร ขนาด 4 x 20 เมตร 1 หลัง จำนวน 20,000 บาท 
• ปี 2519 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียนแบบ 017 ชั้นล่างเต็มรูปแบบ 4 ห้องเรียน จำนวน 100,000 บาท 
• วันที่ 24 มิถุนายน 2519 สภาตำบลจะโหนง จัดสรรเงินก.ส.ช. ให้ก่อสร้างส้วมถาวรเพิ่มเติมตามแบบที่มีอยู่แล้ว 5 ที่นั่ง จำนวน 15,000 บาท 
• ปี 2521 ได้รับงบประมาณ จำนวน 123,000 บาท เปลี่ยนโครงหลังคาอาคารเรียนหลังที่ 1 
• ปี 2523 เปลี่ยนชื่อโรงเรียนเป็น“ชุมชนบ้านทางควาย”
• วันที่ 23 ธันวาคม 2525 ได้รับงบประมาณ จัดสร้างอาคารเรียนแบบ ป.1 2 ห้องเรียน จำนวน 149,000 บาท
• วันที่ 2 ตุลาคม 2526 ต่อเติมโรงฝึกงาน 312 ให้เป็นห้องสมุด 
• วันที่ 12 มีนาคม 2527 ได้รับงบประมาณ จำนวน 350,000 บาท สร้างอาคารอเนกประสงค์ แบบ 203 
• วันที่ 27 สิงหาคม 2528 ได้รับงบพัฒนาจังหวัดจากนายอำเภอจะนะ จำนวน 20,000 บาท สร้างรั้วลวดหนามทางทิศเหนือและทิศใต้ 
• ในปี 2538 ได้รับเงินบริจาคสร้างรั้วคอนกรีตด้านทิศตะวันออกและทิศเหนือ
• ปี 2541 ได้รับเงินบริจาคสร้างอาคารเรียนอนุบาล ขนาด 7 x 30 เมตร 1 หลัง 
• ปี 2543 ได้รับบริจาคสร้างอาคารฝึกปฏิบัติศาสนกิจศาสนาขนาด 8 x 10 เมตร 1 หลัง 
• ปี 2546 จัดกิจกรรมระดมทุนเพื่อปรับปรุงภูมิทัศน์ และทำถนนคอนกรีตเสริมเหล็ก
• วันที่ 14 กุมภาพันธ์ 2547 เปิดธนาคารโรงเรียนอย่างเป็นทางการ
• ปีการศึกษา 2549 ได้รับคัดเลือกให้เข้าสู่โครงการวิจัยพัฒนาหลักสูตร Brain Based Learning (BBL.) โดยได้รับการสนับสนุนงบประมาณจากสถาบันวิทยาการการเรียนรู้ ได้รับคัดเลือกเป็น 1 โรงเรียน 2 ระบบ ได้รับการสนับสนุนวิทยากรอิสลามแบบเข้ม จำนวน 3 คน ตามโครงสร้างสันติสุขจังหวัดชายแดนภาคใต้ 
• ปีการศึกษา 2549 ได้รับคัดเลือกเป็นตัวแทนระดับจังหวัดสงขลาเพื่อเข้ารับการประเมินโรงเรียนรางวัลพระราชทานประจำปี 2549 และ โรงเรียนผ่านการรับรองจากคณะกรรมการสำนักงานการประเมินคุณภาพการจัดการศึกษารอบที่ 1 (สมศ.) ผ่านการรับรองจากคณะกรรมการสำนักงานการประเมินคุณภาพการจัดการศึกษารอบที่ 2 (สมศ.) วันที่ 25 พฤษภาคม 2549 
• ปีการศึกษา 2555 ผ่านการรับรองจากคณะกรรมการสำนักงานการประเมินคุณภาพการจัดการศึกษารอบที่ 3 (สมศ.) วันที่ 21 มิถุนายน 2555 และได้รับคัดเลือกให้เป็นสถานศึกษาแบบอย่างการจัดกิจกรรมการเรียนรู้ และการบริหารจัดการตามหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง 
• ปีการศึกษา 2556 ได้รับการประเมินเป็นโรงเรียนดีประจำตำบล และได้รับรางวัลเหรียญทอง รองชนะเลิศอันดับที่ 2 กิจกรรม “มาร์ชชิ่ง ความดี” เพื่อสร้างความดีพื้นฐานสากล 5 ประการ ระดับชั้น ป.1 – ป.6 งานศิลปหัตถกรรมนักเรียน ภาคใต้ ครั้งที่ 63 
• ปีการศึกษา 2557 ได้รับโล่เกียรติคุณเป็นสถานศึกษาพอเพียงต้นแบบ ระดับเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสงขลา เขต 3 โครงการขับเคลื่อนหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง สู่สถานศึกษาเพื่อพัฒนาเป็นสถานศึกษาต้นแบบและศูนย์การเรียนรู้
• ปีการศึกษา 2558 ได้รับรางวัลชนะเลิศเหรียญทอง จากการประกวด“มาร์ชชิ่งความดี”ชิงถ้วยพระราชทานฯ ปีที่ 3 ระดับภาคใต้ และรางวัลเหรียญเงิน จากการประกวด “มาร์ชชิ่งความดี” ชิงถ้วยพระราชทาน ฯ ปีที่ 3 ระดับชาติ 
• ปีการศึกษา 2559 เข้าร่วมโครงการโรงเรียนประชารัฐ 
• ปีการศึกษา 2561 ได้รับรางวัล ชนะเลิศ ประเภทชายล้วน การแข่งขัน การสวดมนต์แบบทำนองสรภัญญะ ระดับภาคใต้
• ปีการศึกษา 2562 ได้รับรางวัลชนะเลิศการสวดมนต์หมู่ทำนองสรภัญญะ ระดับจังหวัด ประเภททีมชายล้วน และได้รับเหรียญทองการประกอบอาหารนักเรียนบกพร่องทางการเรียนรู้ ระดับภาคและประเทศ
• ปีการศึกษา 2564 ผ่านการรับรองจากคณะกรรมการสำนักงานการประเมินคุณภาพการจัดการศึกษารอบที่ 4 (สมศ.)
• ปีการศึกษา 2565 ได้รับรางวัลระดับเงิน ในการประกวดโครงการสถานศึกษาสีขาวปลอดยาเสพติด
• ปีการศีกษา 2566 ได้รับรองเป็นโรงเรียนคุณภาพมาตรฐานกิจกรรมวิทยาศาสตร์สำหรับประถมศึกษา บ้านนักวิทยาศาสตร์น้อย ตามพระราชดำริสมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ได้รับรางวัลเหรียญทองการแข่งขันการสร้างสรรค์ภาพด้วยการปะติด, การประกวดมารยาทไทยระดับช่วงชั้น ป.1-ป.3 การแข่งขันประติมากรรม ระดับช่วงชั้น ป.1-ป.3 การแข่งขันการสร้างสรรค์ภาพด้วยการปะติด ระดับช่วงชั้น ป.1-ป.3 ในกิจกรรมการแข่งขันศิลปหัตถกรรมนักเรียน เบญจรงค์สงขลา 3 ครั้งที่ 9 ได้รับรางวัลระดับทอง ในการประกวดโครงการสถานศึกษาสีขาวปลอดยาเสพติด

             ปัจจุบันนางณัฐกานต์ ชูช่วย อิ๋วสกุล ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนชุมชนบ้านทางควาย ตั้งแต่วันที่ 19 ตุลาคม 2564 โรงเรียนชุมชนบ้านทางควาย เป็นโรงเรียนขนาดเล็ก เปิดทำการสอน ระดับปฐมวัยและระดับประถมศึกษา ในปีการศึกษา 2567 มีนักเรียนจำนวน 109 คน